沙漠地鼠龟生活在干燥的沙漠地区，不同于沙漠的深处，沙漠地鼠龟生活在沙漠的边缘地带，有丰富的食物资源，环境也没有那么恶劣，是比较理想的生存及躲避天敌的地方，但是沙漠地鼠龟的繁殖比较困难，所以一直以来这种龟的数量都不多。
沙漠地鼠龟栖息于长有仙人掌及有刺植物的干燥环境。可以挖掘深达10公尺的长穴，成为其藏身地。草食性，以当地的植物青草、花、仙人掌和豆类为食。非本地植物，很少吃。
沙漠地鼠龟生活环境位于加尼幅尼亚洲及亚州及亚利桑那州的两座沙漠。为干燥草原、沙漠岩石区域，栖息高度海拔约3000~4000公尺，沙漠地鼠龟活动地形倾向于陡峭，倾斜的岩石山坡，那里富产各种仙人掌类植物，种类达300多种，是沙漠地鼠龟最为主要的食物，这个特殊环境对于沙漠地鼠龟存活非常重要，大约6岁的沙漠地鼠龟在野外最主要的威胁就是当地的美洲狮，所以密集的仙人掌群，正好为沙漠地鼠龟制造一个安全的庇护所。
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